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代謝π析(一)——誘導大鼠S9代謝反而最慢?

更新時間:2026-01-22點擊次數(shù):52

引言

在體外代謝與毒理研究中,一個“反常"的數(shù)據(jù)點,往往是通往更深層認知的入口,尤其近年來,隨著藥物研發(fā)新規(guī)頒發(fā),代謝和毒理領域進一步交叉融合,需要我們用“跨界"的思維分析并解決問題。#代謝π析#專欄,正是為了系統(tǒng)解讀這些關鍵案例而設立。

我們將不止于呈現(xiàn)數(shù)據(jù),更于剖析背后復雜的酶學機制、物種差異及實驗設計原理,揭示數(shù)據(jù)如何真正轉(zhuǎn)化為研發(fā)決策。本專欄依托#齊氏生物#在體外毒理和藥代試劑領域的深厚積累,旨在為毒理與藥代動力學研究人員提供一個持續(xù)交流、碰撞思想的平臺。

歡迎關注,與我們一起探索體外研究的奇妙世界!


誘導不是通用的,有時它甚至會揭示隱藏更深的新藥研發(fā)機制。

最近齊氏生物服務團隊,接到客戶提供的一組肝 S9 代謝穩(wěn)定性的數(shù)據(jù),結果卻讓所有人都皺起了眉頭:經(jīng)過經(jīng)典誘導劑處理的大鼠 S9,代謝某些化合物的速度居然比正常大鼠還要慢。這與我們的常規(guī)認知——“酶誘導會加速代謝"——相反。通過深入剖析,我們最終不僅找到了原因,更發(fā)現(xiàn)了一個在體外代謝評估中極易被忽視的關鍵機制。


01 疑點數(shù)據(jù):反常的代謝速率排序

事情起源于一份常規(guī)的體外代謝穩(wěn)定性報告。測試的兩種經(jīng)典藥物——維拉帕米(Verapamil)和(),在正常大鼠、誘導大鼠和人的肝S9組分中,其固有清除率呈現(xiàn)出一個令人費解的趨勢(詳見下表)。

代謝案例 1.png

(表1:大鼠肝S9、誘導大鼠肝S9、人肝S9代謝清除率數(shù)據(jù)對比)


對于這兩種化合物,代謝速率排序出奇地一致:正常大鼠 > 人 > 誘導大鼠。尤其是維拉帕米,其在誘導大鼠 S9 中的清除率,僅為正常大鼠的 15%。這直接挑戰(zhàn)了一個基本假設:用于增強代謝能力的誘導模型,為什么會“失效"?


02 關鍵線索:誘導方案與代謝特性

謎底的關鍵,在于兩個核心信息:

1.    誘導方案:誘導的大鼠肝S9采用 (PB)和 β-萘黃酮(BNF)聯(lián)合誘導,這是一種旨在廣泛上調(diào)多種代謝酶的經(jīng)典“雞尾酒"方案。(詳見文章鏈接:Ames試驗中S9誘導方法解析:從經(jīng)典走向選擇

2.    化合物代謝通路:

· 維拉帕米:主要由 CYP3A 高效代謝,但 CYP2B 也能參與,只是效率較低。

· :幾乎是 CYP3A 的專屬底物,其他酶很少介入。

聯(lián)合誘導的結果是,大鼠肝臟中 CYP1A、CYP2B 和 CYP3A 的酶量會同時被大幅上調(diào)。

問題恰恰出在這個“同時上調(diào)"上。


03 核心機制:“低效通路劫持"效應

我們認為,導致誘導模型代謝減慢的核心機制是 “低效通路劫持"。在正常大鼠或人 S9 中,維拉帕米順暢地經(jīng)由 “高速公路"CYP3A 被快速代謝清除。但在 PB+BNF 誘導的 S9 中,情況變得復雜詳見下圖)


酸化下 3.png

(圖片來源:齊氏生物


1. CYP2B 被 PB 強力誘導,其蛋白表達量的增幅可能遠超 CYP3A。

2. 在有限的體外孵育體系中,超高濃度的 CYP2B 就像無數(shù)條“鄉(xiāng)間小道",它們雖然車速慢(催化效率低),但數(shù)量龐大,能“攔截"大量維拉帕米分子。

3. 結果是,大部分底物被困在了緩慢的 CYP2B 通路上,而真正高效的 CYP3A 通路反而“無車可跑"。

4. 整體代謝速率被數(shù)量占優(yōu)的低效通路拖慢,導致測得的 CLint顯著降低。


這個案例深刻說明,體外代謝數(shù)據(jù)的可靠性不僅取決于實驗設計,更根本地依賴于所用肝S9組分本身的質(zhì)量與一致性。誘導S9并非簡單地將肝臟勻漿,其誘導效率的穩(wěn)定性、各CYP酶活性的平衡,是決定實驗結果能否真實反映代謝潛力的關鍵。這要求供應商必須具備對物種、誘導劑、制備工藝的深刻理解和嚴格質(zhì)控。


04 交叉驗證:數(shù)據(jù)的一致性

數(shù)據(jù)地佐證了這一機制。由于它幾乎只走 CYP3A 這條“高速公路",不受“鄉(xiāng)間小道"(CYP2B)的干擾,因此它在誘導模型中的代謝減慢幅度遠小于維拉帕米。

其減慢可能更多源于 “資源稀釋" ——大量被誘導的其他 CYP 酶與 CYP3A 競爭有限的輔因子資源。這進一步印證了誘導環(huán)境的復雜性。


05 對人肝數(shù)據(jù)的反思與啟示

人肝 S9 的代謝速率介于兩者之間,這給我們兩個重要提醒:

1. 體外模型的局限性:這種 PB+BNF 誘導的大鼠模型未能成功模擬人體對這兩種化合物的基礎代謝速率,在直接用于人體代謝預測時需要格外謹慎。

代謝案例 3.png

2. 反常數(shù)據(jù)蘊含價值:這個“失敗"的預測恰恰暴露了維拉帕米存在一個次要的、低效的 CYP2B 代謝通路。這在常規(guī)模型中容易被忽略,但在特定情況下(如 CYP3A 被抑制時),其相對貢獻可能變得重要。


06 給研究者的實操建議

本案例通過對肝S9代謝穩(wěn)定性數(shù)據(jù)的深度剖析,揭示了與β-萘黃酮聯(lián)合誘導的大鼠肝S9在體外代謝維拉帕米時,因引發(fā)“低效CYP2B通路分流"效應,導致其代謝速率反常低于正常大鼠及人,也為我們未來的體外代謝研究提供了寶貴的經(jīng)驗:

1. 深度解讀,超越數(shù)字

不要僅憑 CLint 的大小做判斷。必須將代謝數(shù)據(jù)與化合物的已知代謝酶譜、所用誘導劑的特異性作用譜相結合,進行機制化解讀。

2. 表征模型,提供背景

在使用誘導 S9 時,強烈建議同步測定關鍵 CYP 亞型的標志性酶活性(如用探針底物)。這份“酶活性背景報告"是正確解讀代謝數(shù)據(jù)的“說明書"。

3. 謹慎外推,體內(nèi)驗證

體外觀察到的強烈“競爭"或“分流"效應,在體內(nèi)由于肝血流和生理性調(diào)節(jié)可能被弱化。關鍵的體外反常發(fā)現(xiàn),必須通過體內(nèi)藥代動力學研究進行最終驗證。

4. 利用反常,發(fā)現(xiàn)新知

當數(shù)據(jù)與預期不符時,這往往是發(fā)現(xiàn)新代謝通路、新酶-底物關系或新相互作用的契機。應設計后續(xù)抑制實驗或重組酶實驗進行追蹤。

因此,要避免此類復雜代謝干擾的誤判,或確保代謝穩(wěn)定性篩查的準確性,從源頭選擇高質(zhì)量、特性明確的肝S9產(chǎn)品至關重要。專業(yè)供應商(如齊氏生物)提供的每一批次產(chǎn)品都附帶詳細的酶活性鑒定COA報告,這不僅是質(zhì)量憑證,更是研究人員解讀數(shù)據(jù)、設計后續(xù)實驗的科學依據(jù)。


07 我們的思考

體外代謝穩(wěn)定性實驗是新藥研發(fā)的常規(guī)環(huán)節(jié),但其數(shù)據(jù)的解讀遠非“數(shù)字大小"那么簡單。本案例揭示的 “低效通路劫持" 效應,正是專業(yè)深度的體現(xiàn)。它要求我們從“數(shù)據(jù)報告者"轉(zhuǎn)變?yōu)?nbsp;“機制解讀者",理解每一個數(shù)字背后復雜的生物學邏輯。

未來,齊氏生物服務團隊將繼續(xù)分享這些來自一線實驗室的深度案例分析,希望能與業(yè)界同行共同探討,提升臨床前研究的預測度和科學深度。因為每一次對反常數(shù)據(jù)的深入探究,都可能讓我們離藥物的真相更近一步!

本文由專注于高質(zhì)量體外代謝與毒理研究工具的#齊氏生物#提供技術支持。

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